目前偏头痛的诊断还存在很多困难。它的症状非常剧烈，又常与其他疾病混淆，比如中风、心脏病、脑膜炎或者脑肿瘤。大部分偏头痛可以通过排查家族病史、发病症状、排除其他疾病等手段确诊。

因为还没有确诊偏头痛的可靠方法，医生通常会进行如下检查：

MRI（核磁共振成像）：这项检查可以对脑组织进行扫描，检查脑肿瘤、脑膜炎或其他神经系统疾病。扫描仪的强磁场可以记录脑组织信号。患者躺在平台上被送入管道内，磁共振仪会发出嗡嗡声，医生由此获得患者大脑的三维成像。一次检查大约持续二十到四十五分钟。

医生常使用MRI检查颅内病变

CT扫描（计算机断层成像）：这项检查可以排查淤血或者脑内癌变。CT扫描使用精细X射线，每条射线都是一束X光，通过多条射线的多角度扫描即可合成脑组织的三维影像。有时医生还会注射静脉背景染料，以保证图像清晰。一次检查大约15分钟。

脊穿：脊穿检查主要针对严重的脑部疾病，如细菌性脑膜炎、脑炎等，也可以检查癌变和多发性硬化。医生在进行检查时首先要对脊柱麻醉，然后用长针头穿刺底部脊韧带收集脑脊液——这是一种保护大脑和脊柱的液体。

偏头痛症状各有不同，有人伴有先兆，如视野边缘的闪光、色块和盲点等，或是面部和手部的麻木感和针刺感。先兆可能在偏头痛发作前十分钟到三天内的任何时间出现。

有时，像普通型偏头痛患者等没有先兆的病人，在发病前会有其他较温和的症状，如欣快感和认知障碍（听说读写困难，难以理解简单句子）。除眼性偏头痛和腹性偏头痛以外。大多数偏头痛发作时，患者会感到颅内一侧或两侧出现阵阵抽痛，很多人还伴有恶心、呕吐、食欲不振和疲乏无力等症状。

特殊症状
部分患者偏头痛发作时没有疼痛感，但是会有奇怪的症状，例如胃肠胀气、干渴、尿频、幻觉（幻嗅、幻视和幻肢感）、暴食或暂时失明。